
Sezon 1999/00 był 33 sezonem Pogoni w ekstraklasie.
Końcowy efekt to 13 miejsce, zdobyliśmy 34 pkt. w 30 spt.[8 zwycięstw, 10 remisów i 12 porażek], bramki 42 – 53.
Spadły ŁKS 28 pkt. i Lech 25 pkt.
Mistrzostwo zdobyła Polonia Warszawa.
W pucharze Polski portowcy odpadli w 1/16 po porażce z Ruchem Chorzów 2-0[0-0]],